A MUCEM megjelenése az év legfőbb, de nem egyetlen eseménye Marseille-ben, amely a 2013-as Európa Kulturális Fővárosa: ezen kívül a régi kikötőben megjelent a Stefano Boeri Kulturális Központ és a Norman Foster pavilon. De a MUCEM egy sokkal nagyobb vállalkozás, amelyet 2000-ben fogalmaztak meg. Ez talán az első múzeum a világon, amelyet a Földközi-tenger egészének szenteltek - ez a régió egyedülálló történelmi és kulturális gazdagságában.
A múzeum, amely az egykori J4-es mólón található, az építész terve szerint a láthatárra és a túlsó Afrika felé néz, és így egyesíti a Földközi-tenger két partját.
Az épület egy 72 m oldalú tér, amelyen belül egy másik, már 52 m oldalú tér van elrejtve, ahol két szinten van kiállítási galéria és egy konferencia terem 325 fő számára. A homlokzat és az épület „magja” közötti résben lépcsők vannak, amelyeken a látogatók felmásznak az ellenőrzés során. Ennek eredményeként a tetőn találják magukat, ahol egy 115 m hosszú gyalogos hídon (77 m fesztávolságon) mennek át Fort Saint-Jean-ba, ahol a múzeum kiállításának második része található. A híd, az áttört homlokzat és az épület üvegprizmáját borító tető, faszerű szerkezeti tartóelemek - mindegyik nagy teherbírású szálerősítésű betonból készül.
Az épület teljes területe 15.000 m2 volt, amelyből a kiállítótermek 3600 m2-t tesznek ki (lesz állandó kiállítás, amelyet 3-5 évente cserélnek, és időszaki kiállítások lesznek). Az új épület költségvetése, a kiállítás megtervezésével együtt, 113,4 millió eurót tett ki, és összesen 191 millió eurót költöttek a MUCEM-re, amely szintén a Saint-Jean erődből és a város restaurációs és levéltári központjából áll.
